Tomographie de réseau appliquée à la simulation et à l’analyse de trafic dans des séquences d’images de microscopie à fluorescence
Résumé
La technique de marquage avec la protéine GFP “Green Fluorescent Protein” et la vidéomicroscopie à fluorescence sont des outils d’investigation permettant d’observer des dynamiques et des interactions moléculaires dans des cellules vivantes, tant à l’échelle microscopique qu’à l’échelle nanoscopique. Par conséquent, il est impératif de développer de nouvelles techniques d’analyse d’images capables de quantifier les dynamiques des processus biologiques observés dans ces séquences. Ceci motive notre effort de recherche qui consiste à développer de nouvelles méthodes d’extraction d’informations à partir de données nD. Dans l’analyse de trafic, le suivi d’objets s’appuyant sur des techniques conventionnelles peut s’avérer très complexe, voire impossible, surtout quand un grand nombre de petits objets coalescents sont en interaction. Néanmoins, l’estimation des trajectoires complètes de tous les objets n’est pas toujours nécessaire à la compréhension et la mesure de l’activité cellulaire. En effet, estimer les régions “origine” et “destination” de ces objets peut s’avérer plus pertinente. Dans cet article, nous proposons une approche originale pour inférer les zones “origine” et “destination” à partir d’informations partielles relatives au trafic. Ainsi, le trafic mem- branaire est assimilé à un trafic routier, ce qui permet alors d’exploiter les récentes avancées en Tomographie de Réseau (TR) bien connues dans la communauté réseaux de communication pour étudier le trafic vésiculaire. Cette approche est validée sur des séquences d’images artificielles relatives à la protéine Rab6, une GTPase impliquée dans la régulation du trafic membranaire intracellulaire.
Origine : Fichiers éditeurs autorisés sur une archive ouverte
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