De la complexité génomique à la diversité protéique : Analyse par modélisation et expériences de la régulation de l'épissage alternatif de l'ARN du virus VIH-1
Résumé
Le virus VIH-1 possède un petit génome sous la forme d'une molécule d'ARN en double exemplaire. D'apparente simplicité, ce génome renferme en réalité de nombreux sites donneurs et accepteurs d'épissage, dont l'utilisation combinée permet la production d'une quarantaine d'ARN messagers codant les protéines nécessaires à la multiplication du virus. Comprendre les mécanismes de régulation régissant la production d'ARN messagers viraux est primordial pour envisager le développement de nouvelles approches thérapeutiques, prenant ces mécanismes pour cible. Ces travaux décrivent la caractérisation du rôle clé joué par une famille de protéines humaines, les protéines SR, dans l'épissage de l'ARN du virus VIH-1. A l'aide d'approches expérimentales et de modélisation mathématique, nous étudions les multiples régulations qu'exercent ces protéines aux différents sites accepteurs d'épissage viraux. L'identification de leurs sites de fixation suggère qu'elles agissent en contrecarrant l'effet des protéines humaines hnRNP. Nous discutons le rôle possible de ces protéines régulatrices dans l'expression des diverses protéines virales au cours du cycle du virus VIH-1.